บางครอบครัวมีความขัดแย้งทางศาสนาหรือจริยธรรมกับการสร้างตัวอ่อนหลายตัว นอกจากนี้ ยาที่ใช้ในการกระตุ้นรังไข่ของผู้หญิงอาจทำให้เกิดอาการกระตุ้นรังไข่มากเกินไป (OHSS) การทำเด็กหลอดแก้วยังมีความเสี่ยงเพิ่มขึ้นในการเกิดหลายครั้งหากมีการนำตัวอ่อนกลับคืนสู่มดลูกมากกว่าหนึ่งตัว การทำหมัน อย่างไรก็ตาม ในกรณีที่เหมาะสม อัตราการเกิดหลายครั้งในรอบการผสมเทียมสามารถเท่ากับอัตราการเกิดหลายครั้งในการปฏิสนธิที่เกิดขึ้นเองโดยการย้ายตัวอ่อนตัวเดียว ในกรณีส่วนใหญ่ การทำเด็กหลอดแก้วเป็นขั้นตอนที่มีราคาแพงกว่าการผ่าตัดกลับท่อนำไข่