เทคนิคทั้งสองต้องใช้หัววัดกรดนิวคลีอิกที่มีลำดับที่ตรงกับเชื้อโรคเป้าหมายในตำแหน่งเฉพาะ แต่ RCA ใช้หัววัดกุญแจ ที่มีความจำเพาะสูง เมื่อเชื้อโรคกลายพันธุ์ ลำดับพันธุกรรมของมันก็เปลี่ยนไปเช่นกัน และนักวิจัยต้องออกแบบโพรบใหม่อยู่เสมอ ดังนั้น Sowmya Krishnan,Ruben Soares M.Michael Gromiha แหล่งที่มา เชื้อโรค และ Narayanan Madaboosi ต้องการสร้างเครื่องมือที่ไม่เพียงแต่สามารถออกแบบ PLP เหล่านี้ได้โดยอัตโนมัติเท่านั้น แต่ยังเป็นครั้งแรกที่พิจารณาพารามิเตอร์ทางเทคนิคที่จำเป็นทั้งหมดอย่างเป็นระบบพร้อมกันเพื่อสร้างทั้งระบบ กระบวนการง่ายขึ้นและมีประสิทธิภาพมากขึ้น