สารต้านแบคทีเรียสามารถฆ่าเชื้อโรคได้ตั้งแต่เริ่มต้น เอนไซม์บางชนิดที่พบในน้ำลาย ทางเดินหายใจ และของเหลวในน้ำตาจะทำลายผนังเซลล์ของแบคทีเรีย น้ำเหลือง เมือกในหลอดลมช่วยดักจับเชื้อโรคจำนวนมากที่เราหายใจเข้าไป เพื่อให้พวกมันสามารถเคลื่อนย้ายออกจากทางเดินหายใจโดยโครงสร้างคล้ายขนที่เรียกว่า cilia กรดในกระเพาะอาหารจะหยุดเชื้อโรคส่วนใหญ่ที่เข้าสู่ร่างกายในอาหารที่เรากิน แบคทีเรียที่ไม่เป็นอันตรายบนผิวหนังของเราและเยื่อเมือกในร่างกายของเรายังทำหน้าที่เป็นส่วนหนึ่งของระบบภูมิคุ้มกันอีกด้วย